Se sabe muy poco sobre los primeros años de la estadía en el convento de los dominios en Cuzco, de los tres hijos de Atahualpa. Los Padres se preocupaban de alimentación y de su educación religiosa. Ya en una ocasión anterior, habían tratado los hermanos de obtener la ayuda del Virrey. Juan Quipetupac hijo de Atahualpa y de la Colla Choquesuyo, se había puesto en camino hacia Lima, como su apoderado, pero murió en el viaje.
