A fines de 1855 encontrándose de Gobernador de la Provincia el General don Francisco Robles (ex-alumno de la Escuela) quien también estaba vivamente interesado en dotarla de un director con conocimientos adecuados y la necesaria capacidad didáctica; habiendo encontrado, por oficio del 3 de diciembre recomendaba a don Francisco Prieto como ” Profesor acreditado por sus conocimientos en la materia y su método de enseñanza”. Los servicios del profesor Prieto fueron prontamente contratados por 3 años, con un sueldo de 120 pesos mensuales, por el Comandante General de Marina, el General José Villamil. Prieto se encargaba de la dirección de la escuela y se comprometía a “enseñar a sus alumnos las siguientes materias: Náutica, Artillería, los principales rudimentos de maniobras, dibujo, marítimo y evoluciones de escuadra”.
