Hizo a expedición de la provincia de Esmeraldas, con cien soldados, fundó una población en Atacames, y luego la abandono.
Hijo de Gonzalo de Olmos y hermano de Francisco y Martin de Olmos, era vecino de Puerto Viejo y muy conocedor de aquellas costas, Partidario de Vaca de Castro, en 1542 obtuvo la conquista de la comarca próxima a la bahía de Caráquez y vecina de la gobernación de Pascual de Andagoya que no estaba bien demarcada. Vaca de Castro escribe: “al capitán Juan de Olmos envié a poblar a conquistar lo de la baya de los Caráquez, porque se entraba en ello la gente del Adelantado Andagoya”. Le dieron esta comisión, sobre todo por decidirse conocedor de la famosa mina de Esmeraldas. Fue preso por Santillán, teniente de Gobernador en Puerto Viejo cuando la rebelión de Gonzalo Pizarro. Lo puso en libertad Hernando Bachicao, al pasar por allí en 1546. En 1549-50 se encontraba en España.
1541 Juan de Olmos, Teniente de Gobernador.